• эффективность действующей политики рыболовства с экономической и природоохранной точек зрения;
• негативные социально-экономические последствия введения режима ограничения промысла и действия системы индивидуальных рыбных квот, включая их аренду и куплю-продажу;
• ограничение программ индивидуальных рыбных квот по продолжительности действия;
• порядок выделения иностранным судам рыбных квот и влияние предоставления их зарубежным рыбакам на экономику США;
• сохранение биоразнообразия;
• эффективность действующей в рыболовстве системы контроля и принуждения;
• пороговые критерии адаптации рыболовства к государственной системе управления индивидуальными рыбными квотами;
• правовые гарантии экипажей от произвола судовладельцев;
• потенциальные социальные и экономические затраты и выгоды для общества от деятельности рыбных аукционов и введения платы за ресурсы;
• экономический эффект и выгоды от управления рыболовством с использованием индивидуальных рыбных квот;
• другие проблемы, связанные с ведением устойчивого рыбного промысла, исследование которых Национальная Академия наук посчитает целесообразным.

Академии наук США было предоставлено право на запрос и получение всей информации, необходимой для анализа перечисленных выше проблем.

Координацию научных работ по изучению проблем регулирования рыболовства возглавил Отдел океанических исследований Национального научного Совета. При Совете была сформирована Комиссия из пятнадцати экспертов - представителей развитых стран, где практиковалась торговля квотами. В состав ее вошли не только известные ученые в области экономики, юриспруденции, биологии, социологии, антропологии, но также бизнесмены и управленцы. Комиссия провела встречи с бизнесменами и общественностью в Анкере, Сиэтле, Новом Орлеане, Бостоне, Вашингтоне и округе Колумбия, чтобы выяснить их отношение к проблеме. Во встречах приняли участие более 200 специалистов, подготовивших свыше 300 письменных предложений, комментариев и документов.

В 1999 г. появились первые выводы. Комиссия безоговорочно поддержала необходимость ограничения доступа к водным биоресурсам. Она пришла к заключению, что действующий механизм управления рыболовством с использованием индивидуальных рыбных квот имеет право на жизнь, и мораторий на использование экономических механизмов в управлении рыболовством должен быть снят. Однако, по мнению Комиссии, действующая система применения рыбных квот содержит существенные изъяны, поскольку не может предусмотреть все случаи, возникающие в практике ведения рыбных промыслов, и особенности национальных рыболовств. Системы регулирования рыболовства с помощью квот требуют серьезного совершенствования, должны формироваться и использоваться исходя из конкретных условий рыболовства. Они должны обеспечивать равнодоступность к биоресурсам, гарантировать приоритетное право рыбаков и рыболовных общин, традиционно занимающихся рыбным промыслом, на беспрепятственное пользование ресурсами. Одновременно должны быть повышены возможности контроля за концентрацией судов на промысле и применением орудий и способов лова.

Комиссия предложила различные варианты управления рыболовством на ближайшие годы и в более отдаленной перспективе, но не смогла найти решение всех проблем регулирования американского рыболовства с позиций обеспечения приемлемого баланса интересов общества и рыбаков с сохранностью водных биоресурсов. Оказалось, что очень сложно повернуть процесс вспять и приступить к изъятию промысловой ренты у тех, кто уже привык получать дармовые доходы. До сих пор инициаторы политики индивидуальных рыбных квот остаются неуверенными относительно механизма использования их в регулировании рыболовства. Поэтому научные исследования, активизированные решением Конгресса США, не только продолжаются, но и набирают силу, находя широкое отражение в СМИ.